Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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