Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RdxP26043 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RdxP26043 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RdxP26043 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RdxP26043 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RdxP26043 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RdxP26043 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RdxP26043 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RdxP26043 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RdxP26043 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RdxP26043 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RdxP26043 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RdxP26043 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RdxP26043 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms