Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tnnc2P20801 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tnnc2P20801 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc2P20801 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms