Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou5f1P20263 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms