Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cxcl9P18340 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cxcl9P18340 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cxcl9P18340 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cxcl9P18340 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cxcl9P18340 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cxcl9P18340 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cxcl9P18340 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cxcl9P18340 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl9P18340 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl9P18340 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl9P18340 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl9P18340 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl9P18340 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl9P18340 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl9P18340 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl9P18340 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl9P18340 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl9P18340 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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