Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms