Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms