Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms