Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01789 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01789 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01789 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01789 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01789 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01789 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01789 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms