Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01641 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01641 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01641 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms