Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3278L7N2D2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms