Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm20918J3QN17 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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