Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4bG5E8Z2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Taf4bG5E8Z2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Taf4bG5E8Z2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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