Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

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Length 4,059 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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Pkhd1E9PZ36 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
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Pkhd1E9PZ36 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Pkhd1E9PZ36 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
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Pkhd1E9PZ36 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Pkhd1E9PZ36 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Pkhd1E9PZ36 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Pkhd1E9PZ36 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Pkhd1E9PZ36 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Pkhd1E9PZ36 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Pkhd1E9PZ36 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms