Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Srp54bE9PXC0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms