Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sfta2E9PXB6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms