Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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