Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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