Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprsB0V2N1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprsB0V2N1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprsB0V2N1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprsB0V2N1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms