Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CtcflA2APF3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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