Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syndig1A2ANU3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms