Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms