Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn7Q9Z261 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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