Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms