Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nfe2l3Q9WTM4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms