Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms