Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mkrn1Q9QXP6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mkrn1Q9QXP6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mkrn1Q9QXP6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mkrn1Q9QXP6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mkrn1Q9QXP6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mkrn1Q9QXP6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mkrn1Q9QXP6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mkrn1Q9QXP6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mkrn1Q9QXP6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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