Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim44Q9QXA7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim44Q9QXA7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim44Q9QXA7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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