Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms