Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capn15Q9JLG8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Capn15Q9JLG8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms