Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clstn1Q9EPL2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms