Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms