Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MNCb-2875Q9DCB3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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