Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms