Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nop56Q9D6Z1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms