Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MsraQ9D6Y7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MsraQ9D6Y7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MsraQ9D6Y7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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MsraQ9D6Y7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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MsraQ9D6Y7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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MsraQ9D6Y7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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MsraQ9D6Y7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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MsraQ9D6Y7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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MsraQ9D6Y7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MsraQ9D6Y7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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