Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms