Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms