Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Phf6Q9D4J7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms