Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms