Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms