Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc167Q9D162 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms