Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc3Q9D114 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 865.7 ms