Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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