Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS1

Aldh1b1, Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1b1Q9CZS1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1b1Q9CZS1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms