Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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