Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed5Q9CXE7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed5Q9CXE7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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