Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms