Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms