Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snrpb2Q9CQI7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snrpb2Q9CQI7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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